Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01387J3KSC0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms