Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNPO3Q9Y5L0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms