Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
HECTD4Q9Y4D8 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms