Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAPPC8Q9Y2L5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms