Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2IRD1Q9UHL9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms