Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM5BQ9UGL1 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms