Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VPS29Q9UBQ0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS29Q9UBQ0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms