Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP35Q9P2H5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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