Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL28Q9NXS3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL28Q9NXS3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms