Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSU72Q9NP77 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms