Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDGFDQ9GZP0 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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