Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCSER1Q9C0I3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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