Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RSPO3Q9BXY4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms