Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms