Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RTKNQ9BST9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms