Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RBBP8Q99708 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms