Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CDRT15Q96T59 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CDRT15Q96T59 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CDRT15Q96T59 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CDRT15Q96T59 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CDRT15Q96T59 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CDRT15Q96T59 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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CDRT15Q96T59 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CDRT15Q96T59 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDRT15Q96T59 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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