Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLMNQ96JQ2 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms