Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CHFRQ96EP1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHFRQ96EP1 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms