Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COLGALT1Q8NBJ5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms