Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms