Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP31Q70CQ4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP31Q70CQ4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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