Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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FAM78BQ5VT40 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
FAM78BQ5VT40 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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