Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms