Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.05■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL22Q53GT1 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL22Q53GT1 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms