Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Q499Y3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Q499Y3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q499Y3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q499Y3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Q499Y3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q499Y3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q499Y3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q499Y3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q499Y3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q499Y3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q499Y3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q499Y3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q499Y3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q499Y3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q499Y3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q499Y3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q499Y3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q499Y3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q499Y3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q499Y3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q499Y3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q499Y3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q499Y3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q499Y3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q499Y3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q499Y3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms