Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROX2Q3B8N5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms