Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ISXQ2M1V0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms