Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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RTN1Q16799 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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RTN1Q16799 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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RTN1Q16799 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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RTN1Q16799 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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RTN1Q16799 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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RTN1Q16799 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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RTN1Q16799 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RTN1Q16799 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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