Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FSCN1Q16658 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms