Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECM1Q16610 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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