Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CARTPTQ16568 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms