Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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NTRK3Q16288 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTRK3Q16288 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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