Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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