Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZFHX3Q15911 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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