Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCN9AQ15858 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN9AQ15858 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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