Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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CDSNQ15517 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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CDSNQ15517 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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CDSNQ15517 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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CDSNQ15517 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CDSNQ15517 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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