Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRKQ15262 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms