Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARHGEF6Q15052 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARHGEF6Q15052 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms