Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
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CHD4Q14839 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
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CHD4Q14839 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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CHD4Q14839 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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CHD4Q14839 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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CHD4Q14839 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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CHD4Q14839 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
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