Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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