Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF2H2Q13888 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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