Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
FHL3Q13643 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FHL3Q13643 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms