Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ATRQ13535 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRQ13535 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRQ13535 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRQ13535 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRQ13535 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRQ13535 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRQ13535 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRQ13535 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRQ13535 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRQ13535 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRQ13535 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRQ13535 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRQ13535 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRQ13535 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRQ13535 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRQ13535 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRQ13535 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRQ13535 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRQ13535 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ATRQ13535 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ATRQ13535 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
ATRQ13535 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
ATRQ13535 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
ATRQ13535 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
ATRQ13535 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
ATRQ13535 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
ATRQ13535 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ATRQ13535 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATRQ13535 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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