Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms