Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LSAMPQ13449 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LSAMPQ13449 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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