Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
XRCC4Q13426 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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