Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF5Q13243 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms