Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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GRIK3Q13003 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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GRIK3Q13003 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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