Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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FOXC1Q12948 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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FOXC1Q12948 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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FOXC1Q12948 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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FOXC1Q12948 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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FOXC1Q12948 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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FOXC1Q12948 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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FOXC1Q12948 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXC1Q12948 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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